北京市第二中学学校荣誉该校曾获得全国精神文明建设工作先进单位等荣誉称号
2000年，通过科技事业单位档案管理国家二级的考核，升级为国家二级
2004年，被评为2003-2004年度“全国青少年科技活动先进集体”
2005、2006年连续两年获“首都文明单位标兵”称号
2008年5月，学校钮小桦校长工作室和数学特级教师王文杰工作室获北京市东城区第三届名师、名校长工作室
2009年，被评为北京市创建学习型学校先进单位
2011年1月，北京二中金帆舞蹈团在2010年上海世博会总结表彰大会上获“先进集体”称号
2020年5月，入选北京市中小学科技教育示范学校名单
2021年2月25日，荣获"全国脱贫攻坚先进集体"称号
2021年9月，入选2021年度“全国青少年人工智能活动特色单位"名单
2023年4月，入选北京市中小学艺术教育特色学校名单
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