巢湖市第二中学办学历史学校的前身为1947年天主教会创办的私立皖光初级中学
1952年：改为公办巢县初级中学，校址由北大街天主教堂迁至夫子庙
1953年：私立黄山初级中学并入，学校规模逐渐扩大
1956年：学校被教育厅定为省重点初中
1958年：省炳辉烈士子弟学校并入，学校规模进一步扩大，建制达18个班，学生近千人，成为当时全省著名的初级中学之一
1960年元月：省长黄岩在全省大、中、小学教师万人大会上，亲授该校奖旗一面，以示表彰
同年，改名为巢县第二中学
增设高中部
1978年：学校被巢县县委、县政府定为县重点中学
1984年：县改市，学校亦随之改名为“巢湖市第二中学 ”
同年，学校被巢湖地委、行署定为巢湖地区重点中学
2000年：地改市学校随之上划为市直属中学
2001年：学校被命名为市级示范中学
同年，巢湖市技工学校并入该校，设立初中分部（即分校）
2003年8月：遵照市政府关于市属三校（一中、二中、东风路小学）联动搬迁的决议，该校迁至原市一中校址
2005年：学校被安徽省教育厅命名为”安徽省示范高中“
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