广州市第三中学建国以后1952年9月，启育中学（即圣心中学）与明德女中合并成广州市第三中学
1951年5月10日，三中少先队在广州成立，成为广州优秀少先队组织
1957年，中共三中党支部成立，由陈平任书记，建立党支部领导下的校长负责制的管理体制
1952年2月至1966年6月，完成了归并工作，广州市第三中学成为全日制公立完全中学
1966年6月，工宣队进驻学校，导致教育思想和教学常规混乱，致使广州三中停止了教学和常规工作
1978年，被评为广州市越秀区重点中学和广州市先进单位
1986年，被广州市教育局定为校长负责制学校，由马毓钧任校长，施行校长负责制的管理体制
1993年12月，被广东省教育厅评定为省一级学校
2001年，被评为广州市国家级示范性高中学校
2004年11月，广州市96中撤消，其53名教师和8个教学班（初二2个班，初三6个班）的学生并入广州市第三中学
2007年12月，通过了广东省国家级示范性高中验收确认
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