广东仲元中学建国之后“文化大革命”期间学校曾易名“市桥一中”、“番禺县第一中学”
1980年1月，学校恢复在“文革”动乱期间被取消的“广东仲元中学”校名，恢复学校办学体制，定为番禺县全日制完全中学
1994年，广东仲元中学被评为首批广东省一级学校
1998年，改为全日制高中
2006年，通过首批广东省国家级示范性普通高中督导验收
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