湛江市第二中学合并建校1950年10月，由已在现址的市立一小、正义中学两所学校校长受政府委派接收私立中正中学，亦迁入现址，改名湛江市第二中学
1951年至1953年，麻斜中学和益智中学先后并入
1960年，学校被评为湛江市重点中学
1968年，学校高中部迁往录塘，再迁三岭山，立名湛江市工农学校，先后开办平乐、新场农村分校
“文化大革命”后，平乐、新场农村分校撤回
1978年，学校再次被评为湛江市重点中学
1997年，与湛江海洋大学合办湛江海洋大学附属中学（初中）
2000年，湛江海洋大学附属中学停招新生；同时，新自办湛江市港城实验中学（初中）
2005年9月，学校高中部开始搬迁至位于开发区的新校区
2007年，湛江市港城实验中学并入湛江市第二中学；同年，创办湛江二中港城中学
2008年5月，学校被评为第一批广东省国家级示范性普通高级中学； 同年7月，学校组建湛江二中教育集团
2015年7月，学校高中部搬迁完成
2018年9月，学校小学部正式开学
2021年3月，学校入选广东省中小学劳动教育特色学校
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