遵义航天中学组织机构办公室：下辖行政、人事、财务三个办公室，对学校日常行政，人事劳资，财务管理工作负责
教务处：负责学校日常教师教学管理，招生、课程、考试日程安排及学生学籍管理
教科处：负责教学课题研究任务、教研目标管理及相关资料的整理归纳
政教处：负责学生的日常行为管理，管理学生宿舍 ，考核班主任对学生的日常管理，学生德育工作的具体落实
总务处：负责学校固定资产的管理和日常维护、维修
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