农业系统工程主要内容主要内容包括：①系统目标的确定
总目标为创造更多的农产品和改善农业生态
系统各组成部分的具体目标如高产、优质、养地、防止水土流失和环境污染等；②系统模型的建立
如农业系统优化，可采用线性规划、非线性规划或多目标规划模型；农业系统预测，可采用回归模型、动态规划模型、系统仿真模型或灰色系统模型等；③系统求解及其结果评价
通过在计算机上的反复调试，可获得满意结果
而对结果的解释，主要依靠研究者本身的实践经验和在农业生产方面的知识素养
要正确处理定量与定性的关系，理论与实践的关系，寻求最佳方案
农业系统工程可在制定全国及各地区实现农业现代化的优化方案、农业规划、农业布局等方面起积极作用
地理学中通过系统模型将农业系统工程的设计同地理条件和区域特征结合起来
因自然、环境、人文等因素复杂，可变性大，进行定量分析难度较大，故需进行不断探索
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