蛋白质组研究生物信息学蛋白质组数据库是蛋白质组研究水平的标志和基础
瑞士的SWISS-PROT拥有目前世界上最大,种类最多的蛋白质组数据库
丹麦、英国、美国等也都建立了各具特色的蛋白质组数据库
生物信息学的发展已给蛋白质组研究提供了更方便有效的计算机分析软件;特别值得注意的是蛋白质质谱鉴定软件和算法发展迅速,如SWISS-PROT、Rockefeller大学、BHS宝护神、UCSF等都有自主的搜索软件和数据管理系统
最近发展的质谱数据直接搜寻基因组数据库使得质谱数据可直接进行基因注释、判断复杂的拼接方式
随着基因组学的迅速推进,会给蛋白质组研究提供更多更全的数据库
另外,对肽序列标记的从头测序软件也十分引人注目
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