蛋白质组研究临床医药对人类而言，蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康，主要指促进分子医学的发展
如寻找药物的靶分子
很多药物本身就是蛋白质，而很多药物的靶分子也是蛋白质
药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用
在基础医学和疾病机理研究中，了解人不同发育、生长期和不同生理、病理条件下及不同细胞类型的基因表达的特点具有特别重要的意义
这些研究可能找到直接与特定生理或病理状态相关的分子，进一步为设计作用于特定靶分子的药物奠定基础
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