中国应用生理学杂志影响因子据2020年5月15日中国知网显示，《中国应用生理学杂志》总被下载473615次、总被引25214次、（2019版）复合影响因子为1.014、（2019版）综合影响因子为0.783
据2020年5月15日万方数据知识服务平台显示，《中国应用生理学杂志》被引量为20862次、下载量为74088次；据2017年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，该刊影响因子为0.98，在全部统计源期刊（6670种）中排第1526名
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