内蒙古巴彦淖尔国家地质公园生物资源截止2013年，巴彦淖尔国家地质公园范围内约有野生植物94科378属918种，其中蕨类7科7属12种，余下为种子植物

种子植物以草本植物为主，有728种，其中多年生草本占优势，共566种，占野生植物总数的61.65%

另外，有木本植物36科78属178种，以灌木为多，乔木仅占31种

其中有干草、花棒、麻黄、锁阳、沙棘、梭梭、蒙古扁桃、绵刺、裸果木、肉苁蓉等多种名贵药材和稀有植物

 截止2013年，公园内属于国家一级保护的动物有黑鹳(Grusnigricollins)、玉带海雕(Haliaeetusleucoryphus）、白尾海雕（Haliaeetusalbicilla）、大鸨(Tarda)、波斑鸨(Macqueeni)、野驴(Equushemionus)、豹(Pantherapardus)和北山羊(Capraibex)8种，国家二级保护动物有斑嘴鹈鹕(Pelecanusphilippensis)、雀鹰(Sparrowhawk)、红隼(Tinnunculus)、灰鹤(Grusgrus)、红角鸮(Scops)、荒漠猫(Chinesedesertcat)、鹅喉羚(Gazellasubgutturosa)、岩羊(Nayaur)、斑羚（Naemorhedusgoral）、盘羊（Ovisammon）、黄羊（Procapragutturosa）等23种

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