蛋白质数据库异质在PDB文件的异质(heterogen)部分包含了对非标准氨基酸残基的说明
这一部分包含HET、HETNAM、HETSYN、FORMUL等4种记录
HET记录描述了已给出坐标的非标准氨基酸,如:溶性分子、辅基、铁等,同时也描述未知化学名称的异质
在1G3P入口文件里,有关HET的第1条记录为:HET TRO 21 15这里“HET”为记录名称,TRO为HET标识符,21为顺序编号,15为HETATM记录中本组群出现的次数,也就是说,本记录描述了顺序编号为21的非标准氨基酸TRO在坐标入口HETATM记录中出现15次
HETNAM记录描述了具有给定非标准氨基酸标识符的化合物的化学名称
例如,1G3P文件中HETNAM记录之一为:HETNAM SO4 SULFATE ION描述了HET标识符为SO4的化合物的化学名称为SULFATEION
FORMUL记录描述了非标准组群的化学表示式及其所带的电荷数
以上内容由大学时代综合整理自互联网,实际情况请以官方资料为准。