蛋白质数据库二级结构2级结构是指多肽链的主链骨架以肽平面为单位盘曲、折叠而形成的构像

2级结构包括了3种情况：α-螺旋β-片层β-转角

在β-片层中，肽键平面折叠成锯齿状，相邻2个肽键平面之间的夹角呈110°角

在PDB入口文件中，描述蛋白质2级结构的有HELIX、SHEET、TURN3种记录

HELIX记录用于描述分子中α-螺旋结构的位置

给出螺旋的名称和编号，标示出螺旋开始和结束处的残基，以及总长度

SHEET记录用于描述分子中β-片层结构的位置

记录格式与HELIX类似

TURN记录描述折叠和转角

从PDB的Web主页(http://www.rcsb.org/pdb/index.html)可以按大分子的4位代码查找

打开了某个蛋白质大分子的网页后，可以查看总体信息、三维结构、序列细节等，还可以下载PDB入口文件

例如，1ROG的氨基酸序列和2级结构如下：1 GSHSMRYFHT SVS RPGRGEP RFITVGYVDD TLFVRFDSDA ASPREEPRAPEEEEEEEE EE BTTTB EEEEEETT EE EEEETTT TT EESST51 WIEQEGPEYW DRETQICKAK AQTDREDLRT LLRYYNQSEA GSHTLQNMYGTTTSS HHHH HHTHHHHHHH HHHHHHHHHH HHHH TT SS S EEEEEEE101 CDVGPDGRLL RGYHQDAYDG KDYIALNEDL SSW TAADTAA QITQRKWEAAEEE SS B EEEEEEEETT EE EEE TTS EE SHHH HHHHHHHHTT151 RVAEQLRAYL EGECVEWLRR YLENGKETLQ RAXTTHHHHHHHH HTTTHHHHHH HHHH SSSSS这里，每个氨基酸残基用单个字母表示，2级结构(2、4、6、8行)用H表示螺旋，B表示隔离的β桥上的残基，E表示扩展的β链，G表示310螺旋，I表示pi螺旋，T表示氢键转角，S表示弯曲，等

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