北京协和医学院院系专业据2020年9月学校官网显示，学校设有7个学院，共有2个本科专业
院系名称专业名称基础医学院--------临床医学院临床医学护理学院护理公共卫生学院--------人文学院--------研究生院--------继续教育学院--------资料来源： 注：北京协和医学院临床医学（八年制）专业的招生计划纳入清华大学的总招生计划之中，由两校共同完成招生录取工作
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