北京协和医学院科研成果“十五”期间，学校承担各类科研项目共计4639项，其中承担国家级科研项目2869项，占项目总数的61.8%；累计获科研项目资助额达7.8亿
“十一五”初期（2006年）新中标课题经费达4.2亿；累计获各类科技奖励成果209项，其中国家科技进步一等奖1项、国家科技进步二等奖20项、国家自然科学二等奖3项；累计获准专利168项，获新药证书81项（其中一类新药证书9项）；发表SCI论文1888篇
部分重要成果北京猿人发现蛋白质变性学说单体麻黄素提取黑热病研究 部分创造性贡献全国控制和基本消灭麻风根治绒毛膜上皮癌化学疗法的创建与推广脊髓灰质炎系列疫苗的研制食管癌综合防治研究丁苯酞和双环醇等天然药物创制人工麝香研制及其产业化国内首例艾滋病患者发现及新发突发传染病防治体系中国医学细胞遗传学创建与疾病基因研究和自体干细胞临床率先应用理论基础与技术推广
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