首都医科大学学术资源馆藏资源据2019年7月学校图书馆官网显示，图书馆馆藏总量84.91万余册（件），纸质期刊杂志2280种；学校附属教学医院图书馆馆藏书籍52.2879万余册

学校图书馆拥有中、外文学术性全文电子期刊5万余种、电子图书235万余种，形成了以医学文献为主体，包括中外文图书、期刊和报纸合订本、音像制品以及计算机文档等在内的多种类型、多种载体的综合性馆藏体系；可访问86种数据库资源，建设了网上选书系统、虚拟参考咨询系统、学术资源门户网站Metalib/sfx、研究生学位论文库、中医古籍库与解剖资源库等特色平台和数据库

 学术期刊《首都医科大学学报》是由北京市教育委员会主管、首都医科大学主办的综合性医药卫生类学术期刊，创刊于1980年

学报主要刊发基础医学、临床医学、预防医学、药学等领域的新成果、新技术、新经验

设有专家述评、专题报道、论著（基础研究、临床研究）、技术方法、病例报告、短篇论著、综述、学科简介和名师访谈等栏目

该刊是中文核心期刊、中国科技论文统计源期刊、中国期刊方阵的“双效”期刊，被美国化学文摘数据库及其《化学文摘》（CA）、俄罗斯《文摘杂志》（PЖ）、中国学术期刊综合评价数据库、万方数据资源系统数字化期刊群、中文科技期刊全文数据库（维普网）、中国生物医学文献光盘数据库网络版、中文生物医学期刊文献数据库、中国药学文摘、中国医学文摘、台湾华艺中文电子期刊服务—思博网

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