北京大学医学部校友组织北大医学部校友组织为北医校友会，成立于1992年9月28日，是经国家教育部、民政部正式批准的社会团体，准予注册登记（登记证：社证字第3921号）
2004年7月，医学部校友工作开始由专人负责，校友工作办公室正式成立
2007年10月26日，北医校友会换届选举产生新一届理事会、常务理事会和秘书处，校友会会长是北大常务副校长、医学部常务副主任柯杨教授
2012年10月26日，北医校友会第五届校友代表大会召开，选举产生新一届理事会、常务理事会和秘书处，北京大学常务副校长、医学部常务副主任柯杨当选为会长
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