青海农牧科技职业学院院系专业截至2018年12月，学院设5个系，开设26个专科专业，并设有“青海省湟源畜牧学校”
专业设置系（部）专业名称动物科学系畜牧兽医、水产养殖技术、农畜特产品加工动物医学系兽医、动物防疫与检疫、宠物医学、农产品质量检测农林科学系草业技术、植物保护与检疫技术、园林技术、作物生产技术、中草药栽培技术经济管理系经济管理、景区管理、文秘、老年服务、物流管理信息工程系计算机网络技术、计算机多媒体技术
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