陕西中医药大学科研机构截至2020年6月，学校有省部共建重点实验室培育对象“秦药特色资源研究开发重点实验室”、3个国家中医药科研三级实验室、5个陕西省重点实验室、4个陕西省工程技术研究中心、3个陕西省临床研究中心与分中心、2个陕西省重点研究室、13个陕西省中医药科研二级实验室与陕西省免疫炎症相关疾病中医药防治国际联合研究中心、陕西省中药资源产业化协同创新中心、陕西省创新药物研究中心

 省部（教育部）共建协同创新中心陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心 国家中医药管理局科研三级实验室中药制剂实验室分子生物学实验室中药药理实验室国家中医药管理局科研二级实验室中医药分子生物实验室中药鉴定学实验室血管神经生理学实验室藏象分子免疫学实验室针灸推拿实验室血证诊断实验室脾胃病分子免疫实验室中药化学实验室中药物理实验室中西医结合免疫学研究室分子病理学实验室中医骨病理与生物力学实验室中医药分子学与免疫学实验室省级工程技术中心陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西省中药饮片工程技术研究中心陕西省中药资源产业化协同创新中心针药结合创新研究中心 省级重点研究室陕西省中药基础与新药研究重点实验室陕西省中医体质与疾病防治重点实验室 

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