云南交通运输职业学院专业设置2020年，学校设置9个二级学院和2个教学部，即汽车学院、公路学院、航空学院、航运学院、智慧交通学院、公共服务与管理学院、马克思主义学院、国际学院、继续教育学院、基础教学部和体育部
2019年招生专业有汽车运用与维修技术、汽车车身维修技术、汽车营销与服务、道路养护与管理、航海技术、公路机械化施工技术、电子商务技术、空乘服务、飞机机电设备维修、工程造价、新能源汽车技术等23个
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