遵义医药高等专科学校院系专业截至2020年12月，学校有直属附院2所（遵义市第一人民医院、遵义市第五人民医院），非直属附院1所（遵义市中医院），教学医院5所，共有8个教学系（部、院），开设有25个专科专业（方向）
系部专业设置院系名称专业名称护理系助产中医系中医学、针灸推拿、康复治疗技术医学技术系医学影像技术、医学检验技术临床医学系临床医学药学系药学、医药营销卫生管理系防医学、公共卫生管理、医学营养、卫生检验与检疫技术、食品药品监督管理基础教学系 ——
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