川北医学院学科建设截至2022年6月，学校有国家中医药管理局重点学科、省重点学科、省卫健委医学重点学科以及重点建设学科、省中医药重点建设学科等28个，博士后创新实践基地1个，联合培养博士基地1个；硕士学术学位有4个一级学科授权点，涵盖二级学科32个；硕士专业学位有6个授权类别，涵盖专业学位领域34个；临床医学为ESI全球学科排名前1%学科

 一级学科硕士点：基础医学、临床医学、药学、医学技术 二级学科硕士点：人体解剖与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学、法医学、放射医学、药理学、内科学、儿科学、老年医学、神经病学、皮肤病与性病学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、外科学、妇产科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、麻醉学、急诊医学、临床中西医、临床护理学等

专业学位硕士点：临床医学、口腔医学、护理、中医、公共卫生、公共管理 国家临床重点专科：肛肠科

国家中医药重点专科：中医肛肠科

省级重点学科：内科学

省级医学重点学科：医学影像学、风湿免疫学、临床神经生理学、普通外科学、肛肠科、临床检验诊断学、神经病学、神经外科学、麻醉学、肿瘤学、泌尿外科学、心血管内科学等

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