仲恺农业工程学院学术成果截止至2022年6月 ，学校拥有各级各类重点学科14个，获省部级以上科技成果奖多项，其中国家科学技术进步二等奖2项分别为：仲恺为第一完成人的《生物基可降解高吸水性树脂生产开发与应用推广》，仲恺为第四完成人的《桔小实蝇种群持续控制的基础及关键技术系统研究与应用》
在国际、国内知名科技期刊上发表（获收录）论文多篇，其中仲恺为第二署名的《一种新的自花授粉机制——花粉滑动》在国际著名学术刊物《Nature》杂志上发表，实现了广东省学术界在该杂志发表论文零的突破
学校在保水保肥技术；水禽健康养殖；猕猴桃、鹰嘴桃、蓝莓、银杏等优稀水果培育；花生、甜糯玉米杂优利用与育种；病虫害防治；农用化学品开发利用；有机硅高分子材料开发利用；岭南特色食品研发、安全控制与加工；观赏花卉、草坪草等园林植物培育；农业机械化、电气化及自动化；环境保护及人工环境标准化；农业信息化及物联网技术、行业与地方标准制定；农林产业规划及企业经济管理等方面取得了一批重大科研成果，产生了显著的经济社会效益
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