赣南医学院科研平台截至2021年3月，学校有教育部重点实验室1个；有省级科研平台11个；有国家中药现代化工程技术研究中心、国家老年疾病临床医学研究中心各1个；省高校重点实验室2个、省高校人文社科重点研究基地1个；市工程技术研究中心13个

 国家级科研平台：心脑血管疾病防治教育部重点实验室、国家中药现代化工程技术研究中心客家中医药资源研究分中心、国家老年疾病临床医学研究中心赣南分中心省级科研平台：江西省高校科技成果转化和技术转移基地、江西省医用组织工程材料与生物制造重点实验室、江西省油茶医药保健及功能产品开发工程研究中心、中央苏区医疗卫生史与健康中国战略研究中心、江西省结石防治工程技术研究中心、江西省泌尿系统疾病临床医学研究中心、江西省脉管性疾病临床医学研究中心、 江西省恶性肿瘤临床医学研究中心、赣南油茶产业开发协同创新中心、江西省基层卫生服务体系建设软科学研究基地、 赣南医学院农村（社区）医学教育研究中心、 江西省脑血管药理重点实验室、赣南医学院院士工作站、江西省高校临床医学重点实验室、江西省高校天然药物研究与开发重点实验室、 赣南医学院第一附属医院博士后创新实践基地市厅级科研平台：赣州市癌症精准医学工程技术研究中心、赣州市人体音频信号智能诊断工程技术研究中心、赣州市疼痛医学工程技术研究中心 、赣州市实验动物技术研究中心、赣州市客家中医药资源工程技术研究中心 、肿瘤液体活检工程技术研究中心、干细胞临床转化工程技术研究中心、油茶医药保健及功能产品开发工程技术研究中心 赣州市生物材料与生物制造工程技术研究中心、赣州市假肢矫形工程技术研究中心、赣州市生物信息大数据工程技术研究中心、赣州市纳米医学工程技术研究中心 、赣州市癌症症状群管理研究中心 

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