三明学院科研机构截至2022年6月，学校学校拥有40多个科研创新平台，包括国家级“设计+”众创空间1个、省重点实验室3个和省级科技示范基地1个，省级人文社科研究基地和省工程研究中心各1个，以及省级2011协同创新中心3个
省级工程技术研究中心：福建省固定床洁净煤气化工程技术研究中心、药用植物开发利用工程研究中心、三明机械CAD工程研究中心 省级重点实验室：福建省材料工程与结构加固重点实验室省级人文社会科学研究基地：三明学院生态文化研究中心研究所：福建省三明汽车工程研究所、闽台林业研究所、客家文化研究所、计算机应用技术研究所、林产化学与涂料研究所、应用生物技术研究所、资源开发与规划研究所、CAD/CAM技术研究所、生态文化与地方文化研究所、应用化学与化工研究所
其他还有复旦大学——三明学院天然药物工程研究中心、福建省中药材草珊瑚规范化种植科技示范基地、海峡动漫游研发与制作中心等科研机构
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