皖南医学院学术资源馆藏资源据2020年5月学校官网显示，学校图书馆馆藏图书111.96万册、电子图书93.07万册、中外文报刊1073种，有多个中外文数据库，形成了以医药卫生为主，纸质文献与电子文献互补的馆藏文献体系

  学术期刊《皖南医学院学报》是一份综合性的医学类学术期刊，为中国科技核心期刊、中国学术期刊综合评价数据库统计源期刊，设有基础医学、临床医学、法医学、口腔医学、麻醉医学、影像医学、预防医学、护理学、大学生科技园地、短篇报道等栏目

 《中国临床药理学与治疗学》是由中国科学技术协会主管、中国药理学会主办、皖南医学院弋矶山医院承办的国家级学术性月刊，是中国科学引文数据库（CSCD）E库收录期刊，中国科技论文统计源期刊，并被美国《化学文摘》（CA）、日本科学技术振兴机构数据库（JST）、波兰《哥白尼索引》（IC）、西太平洋地区医学索引（WPRIM）、美国《乌利希期刊指南》（Ulrichsweb）等国际数据库收录，设有专论、基础研究、临床药理学（包括药物基因组学及药物蛋白组学等）、定量药理学（包括药代动力学、药效动力学及药物临床评价等）、药物治疗学、综述与讲座、医院药学之窗、短篇报道、读者·作者·编者等栏目

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