浙江中医药大学浙江中医药大学2006年2月，更名为浙江中医药大学

同年，成为推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士学位研究生工作单位

 2007年8月，中医临床基础学科成为浙江省属高校中首个国家重点学科

2007年12月，浙江中医药大学李大鹏研究员当选中国工程院院士，成为浙江省属高校首位自主培养的院士

2010年，入选“国家特色重点学科项目”建设高校

 2011年底，入选国家建设高水平大学公派研究生项目

2013年1月，入选国家级大学生创新创业训练计划项目

2014年1月，省政府批准将杭州医学院（滨江校区）置换给浙江中医药大学

4月，学校入选国家创新人才培养示范基地

 2015年4月，入选国家“卓越医生（中医）教育培养计划”改革试点高校

 9月，富春校区竣工并投入使用

2017年8月，入选第二批浙江省重点建设高校

9月，成为浙江省人民政府、国家中医药管理局、教育部三方共建的高等院校，正式跨入“省部共建”高校行列

  2018年11月，与杭州医学院签订（滨江校区）校区移交协议

 2022年2月，列入浙江首批省属社会评价组织名单

 7月25日，发起成立长三角中医药高等教育联盟

 2022年8月，中国工程院院士王琦教授受聘成为浙江中医药大学特聘教授和学校活态传承经典书院名誉院长

 9月6日，浙江中医药大学松阳研究院成立

 12月10日，担任浙江省新医科发展联盟理事长单位

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