徐州生物工程职业技术学院院系专业截至2022年5月，学校设有11个二级院部，开设专科专业40个
二级院部专业设置药品食品学院药学、中药学、生物制药技术、食品药品监督管理、药品生物技术、食品质量与安全、药品质量与安全、药品生产技术、药物制剂技术、食品生物技术动物工程学院畜牧兽医、动物医学、宠物养护与驯导、宠物临床诊疗技术农林工程学院现代农业技术、植物保护与检疫技术、园艺技术、园林技术、工程造价、建筑室内设计信息管理学院会计、财务管理、电子商务、大数据技术、物联网应用技术、计算机应用技术生物装备学院精密医疗器械技术、制药设备应用技术、机电一体化技术、机械制造与自动化、工业机器人、汽车运用与维修、汽车技术服务与营销卫生健康学院护理、康复治疗技术生态环境学院环境工程技术、环境监测技术马克思主义学院/继续教育学院基础部体育部参考资料：
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