南京城市职业学院学生升学在校学生可在大三上学期末（1月初左右）参加江苏省内专转本报名工作，3月中旬左右参加考试，文科考试科目为语文、英语、计算机，理科考试科目为数学、英语、计算机，总分为400分
学校高度重视专转本工作，校内引进专门的培训机构，加强培训、服务学生，每年都有300余人考入省内40几所全日制本科院校学习，高于全省专转本平均通过率
2020年学校高度重视专转本工作，学校人数最多的的两个二级学院，财金与商贸学院专转本达线率66%，工程与信息学院专转本达线率56%，学生纷纷升入南京信息工程大学、南京工业大学等进一步学习
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