连云港师范高等专科学校科研机构截至2013年12月,学校拥有1个市级重点实验室、 2个市级研究中心、4个市级研究所
市级重点实验室连云港市应用生物技术重点实验室 市级研究中心中国《镜花缘》文化研究中心 、全国维果茨基研究会教育与发展研究中心 、连云港市学生体质健康促进研究中心 市级研究所连云港市文化创意发展研究所、 连云港市民间美术研究所 、海州五大宫调研究所、 农村学前教育研究所 市级重点智库连云港区域文学研究所 市一级学会连云港市《镜花缘》研究会研究基地、连云港市心理学与教育学学会、连云港市哲学与社会学学会、连云港市艺术学会 校级重点研究所校洁净能源与先进材料研究中心、地方文化研究所、中小企业创新发展研究中心、教师发展研究中心校级研究机构初等教育研究中心、学前双语教育研究中心、农村学前教育研究所、儿童文化研究所、语文教育研究所、数学教育研究所、当代油画研究所、诗词研究所、朱智贤心理科学研究所、蒋风之二胡艺术研究所、 人力资源开发研究所、 儿童文化创意研发中心、文化艺术中心、 中小学英语教学研究所和职业发展中心、青少年行为矫正理论研究中心校级研训中心教师教育研训中心、环境艺术设计研训中心
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