南京理工大学合作交流为推进教育国际化进程，南京理工大学先后与包括世界一流大学在内的100多所海外高校建立了密切的合作关系，开展各类交流合作

经国家教育部批准，与美国卡内基梅隆大学举办了中外合作办学项目，培养机器人专业硕士研究生；与德国慕尼黑工业大学等30多所海外知名高校签署了联合培养人才协议，每年选派300多名学生到海外短期学习交流或攻读学位

南京理工大学注重与境外高水平大学和科研机构开展科研合作，先后与德国卡尔斯鲁厄理工学院建立了格莱特纳米科技研究所，与法国里尔科技大学、俄罗斯乌法航空技术大学、白俄罗斯戈梅立国立大学等多所高校和科研机构建立了联合研究中心或实验室，每年来校开展合作研究、讲学等学术交流活动的境外专家学者达400人次之多

截至2019年4月，学校建有国际联合实验室13个，获批国家级国际联合研究中心1个、示范型国家国际科技合作基地1个、高等学校学科创新引智基地5个

与美国卡内基梅隆大学、英国考文垂大学等举办中外合作办学项目，与法国梅斯国立工程师学院共建中法工程师学院，与德国卡尔斯鲁厄理工学院合作建立格莱特纳米科技研究所

与白俄罗斯戈梅利大学共建孔子学院

学校聚焦国家军民融合发展战略，成立江苏省军民融合研究院，推进军民融合深度发展；加快产学研合作步伐，设立了8个校外研究院，发挥国家级技术转移中心的作用，推动重大科技成果的转化应用，服务国家和地方经济社会发展

废弃火炸药再利用、民用爆破、特种超细粉体制备、智能熔敷焊、机器人智能焊接、印鉴真伪自动鉴别系统等技术，填补了相关领域的空白，创造了巨大的经济效益和社会效益

南京理工大学于1994年成立了由多家政府机构和企事业单位组成的南京理工大学董事会，学校与董事单位形成深层次、长期稳定的合作关系，互利互惠、相互支持，实现了校企相互促进与和谐发展

为拓宽筹措办学资金渠道，凝聚各方兴学力量，学校于2006年成立了教育发展基金会，支持学校在人才培养、科学研究和社会服务领域不断追求卓越；社会各界通过基金会设立了60余项奖教金和奖助学金，支持学校在人才培养、科学研究和社会服务领域不断追求卓越

 2017年6月，加入工信部所属7所高校（哈尔滨工业大学、西北工业大学、哈尔滨工程大学、南京航空航天大学、南京理工大学、北京航空航天大学、北京理工大学）组成的工业和信息化部高校联盟

  同月，南京理工大学与南京市中西医结合医院签定全面战略合作协议，共建医工结合创新研究院

 2021年5月16日，全国高等军工院校课程思政联盟成立大会在南京理工大学举办

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