上海海关学院科研成果2017年，上海大学和上海海关学院联合申报的《分数阶微分方程的数值方法》项目获2017年度上海市科学技术自然科学奖三等奖

 2020年，学校获批2项教育部人文社会科学研究一般项目，1项2020年度教育部人文社科基金中国特色社会主义理论体系研究专项，2项上海市第二批教育科学研究项目，1项上海市人民政府决策咨询研究重点项目，1项上海市软科学重点项目，2项2020年度上海市哲社规划一般课题，2项2020年度国家社科基金项目

 2019年上海海关学院省部级及以上课题立项表项目名称课题名称项目类别国家哲社规划办近代长三角口岸城市灾害协同治理研究青年项目国家自科高阶延时微分方程组稳定化的数值方法面上项目教育部人文社科基金英汉关务词汇书编纂与研究规划基金项目加快推进我国与“一带一路”国家FTA网络构建研究青年基金项目面向跨境供应链合规的信息协同机制研究青年基金项目上海市自科项目分数阶微分方程数值分析中几个关键问题的研究面上项目上海市软科学研究重点项目进口税收政策支持上海科技创新有关问题研究重点项目署级课题以贸易规则为基础的国际多边贸易体系研究署级课题上海市人民政府决策咨询课题深化自贸试验区建设背景下航运相关产业发展研究国际航运中心专项上海市哲社动态随机一般均衡（DSGE）模型理论框架与应用分析前沿进展研究一般项目开放和安全视角下上海自贸区离岸贸易监管制度创新研究一般项目基于海关信用管理的跨境电商发展创新及风险防控研究一般项目 

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