吉林工程职业学院院系专业据2022年6月学校官网显示，吉林工程职业学院设立粮油食品学院、机电工程学院、汽车工程学院、信息工程学院、生物工程学院、医护学院、建筑工程学院、管理学院8个学院，38个专科专业
院系名称专业方向粮油食品学院粮食工程、粮油储藏与检验技术、食品营养与检测、农产品加工与质量检测机电工程学院机械设计与制造、数控技术、汽车制造与装配技术、机电一体化技术、电气自动化技术、工业机器人技术生物工程学院农业生物技术、畜牧兽医、宠物医疗技术汽车工程学院汽车检测与维修技术、汽车电子技术、汽车营销与服务、新能源汽车技术管理学院会计电算化、休闲旅游、电子商务、连锁经营管理信息工程学院计算机应用技术、计算机网络技术、网站规划与开发、动漫设计与制作、建筑动画设计与制作、数字媒体动画设计与制作建筑工程学院工程造价、建筑工程技术、建筑工程管理医护学院护理参考资料：
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