吉林医药学院院系专业截至2016年11月，学校开设有马克思主义学院（人文社科学院）、基础医学院、药学院、护理学院、公共卫生学院、管理学院、检验学院、生物医学工程学院、应用心理学院等9个教学院系
设有17个本科专业及专业方向，6个专科专业，涵盖医、理、工、管4个学科门类
本科列表院系名称本科专业学制马克思主义学院基础医学院医学影像学五年预防医学五年药学院药学（临床药学方向）五年药物制剂四年医药营销四年护理学院护理学四年护理学（英语护理方向）四年 公共卫生学院食品卫生与营养学四年 生物医学工程四年公共事业管理（卫生事业管理方向）四年食品质量与安全四年信息管理与信息系统四年管理学院公共事业管理四年市场营销四年检验学院医学检验四年医学检验（临床输血方向）四年生物技术四年生物医学工程学院生物医学工程四年学信息工程四年 应用心理学院应用心理学 四年 专科列表学校专业名称学制吉林医药学院口腔医学、药学、护理、医学影像技术、医学检验技术三年
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