沈阳药科大学学科建设据学校2021年2月官网显示，学校是国家首批获得博士、硕士学位授予权的单位之一，有招收港澳台地区学员及外国留学生、国内高中保送生资格；有博士后流动站2个（药学、中药学），一级学科博士学位授权点2个，二级学科博士学位授权点19个，一级学科硕士学位授权点7个，二级学科硕士学位授权点53个，硕士专业学位授权点3个；药剂学科为国家级重点学科，中药分析学为国家中医药管理局重点学科，中药药理学为辽宁中医药管理局重点学科；获批辽宁省“建设一流大学”之一，药学、中药学分别获批建设“世界一流学科”和“国内一流学科”

 根据2021年1月ESI发布的数据，药理学与毒理学、化学、临床医学3个学科稳定进入ESI全球前1%，其中药理学与毒理学进入全球前7‱

 重点学科国家级重点学科（1个）：药剂学国家中医药管理局中医药重点学科（1个）：中药分析学辽宁省重点学科（2个）：药学（一级学科）、中药学（一级学科）辽宁省特色学科建设工程“提升学科”（2个）：药物化学、药物分析学辽宁省特色学科建设工程“特色学科”（1个）：中药学（一级学科）沈阳药科大学校级重点学科（3个）：生物化工、应用化学、企业管理 博士后科研流动站（2个）：药学、中药学 博士学位授权点博士学位授权点一览表学科门类一级学科二级学科一级学科二级学科医学药学药物化学中药学中药化学药剂学中药生物技术学生药学中药药理学药物分析学中药制剂学微生物与生化药学中药鉴定学药理学中药分析学制药工程中药炮制学天然药物化学中药资源学药事管理学--临床药学--药学信息学--硕士学位授权点硕士学位授权点一览表学科门类一级学科二级学科学科门类一级学科二级学科医学药学药物化学工学化学工程与技术化学工程药剂学化学工艺生药学生物化工药物分析学应用化学微生物与生化药学工业催化药理学生物与医药工程（专业学位）制药工程理学化学无机化学天然药物化学分析化学药事管理学有机化学临床药学物理化学药学信息学高分子化学与物理药学（专业学位）生物学植物学中药学中药化学动物学中药生物技术学生理学中药药理学水生生物学中药制剂学微生物学中药鉴定学神经生物学中药分析学遗传学中药炮制学发育生物学中药资源学细胞生物学中药学（专业学位）生物化学与分子生物学中西医结合中西医结合基础生物物理学中西医结合临床管理学工商管理会计学管理学工商管理旅游管理企业管理技术经济及管理学科排名教育部第三轮全国高校学科评估结果发布，沈阳药科大学共有7个学科参评，2个学科排在前10位，其中，药学排在第4位，中药学排在第9位

 学科名称（一级学科）所属分类排名药学医学4中药学医学9中西医结合医学23生物学理学53化学工程与技术工学58化学理学69工商管理管理学100全国第四轮学科评估结果于2017年12月28日公布，沈阳药科大学共有7个一级学科参评，其中药学一级学科评估结果为“A”级，在全国104所参评高校中位居第二档，进入前5%，比上一轮评估排名前进了3.33%，是辽宁省高校中排名最高的学科之一；中药学一级学科评估结果为“B”级，在全国43所参评高校中位居第四档，进入前30%，比上一轮评估排名前进了2.14%

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