沈阳药科大学院系专业据2021年11月学校官网显示，学校设有12个学院，开设21个本科招生专业、1个国际合作办学专业、2个第二学士学位专业、6个成人本科专业
学院本科专业沈阳药科大学药学院药物制剂、药学、药学（英语强化班）、药学（日语强化班）、药物分析沈阳药科大学制药工程学院制药工程、环境科学、应用化学、药物化学沈阳药科大学中药学院中药学、中药学（日语强化班）、中药资源与开发、中药制药沈阳药科大学生命科学与生物技术制药学院临床药学、生物工程、生物制药（生命基地班）、生物制药沈阳药科大学工商管理学院工商管理、市场营销、药事管理沈阳药科大学医疗器械学院生物医学工程、医疗产品管理、生物医学工程（中外合作办学）沈阳药科大学功能食品与葡萄酒学院食品科学与工程、葡萄与葡萄酒工程、食品质量与安全沈阳药科大学文体学院- 沈阳药科大学继续教育学院- 沈阳药科大学无涯创新学院药学（理科基地班）沈阳药科大学马克思主义学院- 沈阳药科大学亦弘商学院-参考资料：
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