山西药科职业学院院系设置截至2018年12月，学院设有中药系、制药工程系、工商管理系、药学系、器械工程系、食品工程系6个教学系，21专科个专业
2020年与长治医学院联合开展药学高本贯通专业人才培养工作
高本贯通本科学校三年专科段专业名称后两年本科段专业名称计划长治医学院药学药学60 专科专业院系专业工商管理系药品服务与管理、药品经营管理、连锁经营管理、电子商务、物流管理食品工程系农产品加工与质量检测、食品生物技术、食品营养与检测药学系药学、药品质量与安全制药工程系中药制药技术、药物制剂技术、生物制药技术、精细化工技术、兽药制药技术中药系中药学、中药生产与加工、中草药栽培技术、药品质量与安全器械工程系医疗器械维护与管理、制药设备应用技术
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