山西医科大学晋祠学院院系设置学院现设有临床医学系、护理学系、口腔医学系、预防与管理学系、检验学系、康复治疗学系、影像学系、基础部等八个系部；开设有临床医学、口腔医学、麻醉学、护理学、预防医学、医学检验技术、医学影像技术、康复治疗学、口腔医学技术、眼视光学、药学、药物制剂、中药学等十三个专业

2017年,口腔医学专业获批山西省教育厅省级高等学校本科优势专业建设项目；2018年,护理学专业获批山西省教育厅省级高等学校本科优势特色专业建设和扶持项目

2019年，临床医学和麻醉学专业提交申报山西省教育厅优势专业群建设项目

学院招生层次包括普通高考、对口升学和普通专升本三个层次，招生来源以山西省内为主，面向福建、安徽、陕西、湖北等部分省份招生

2019年学院获批招收国际留学生资格

 教学实习医院学院依托山西医科大学的优质资源，先后在山西、北京、天津、新疆等地建立了52所教学医院和实习基地，形成范围广、综合实力强的教学实践基地群

2019年，新增新疆兵团第六师医院为教学医院并举行了挂牌仪式；与大同市第三、第五人民医院、同煤集团总医院等三甲医院建立了实习基地，为学生临床见习、实习以及就业搭建了更广阔的平台

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