曲阜师范大学科研平台根据2021年7月学校官网信息显示，学校建有省部级协同创新中心5个，9个省级重点实验室，2个省级工程技术研究中心，2个山东省“十三五”高校人文社科研究基地，1个省级重点智库，教育部、国家体育总局、山东省政府在学校设有8个省部级研究基地，获批成立山东省生命与安全教育研究中心

 山东省级重点实验室：山东省激光偏光与信息技术实验室、山东省生命有机分析实验室、山东省南四湖湿地生态与环境保护实验室（强化）、山东省智能控制技术实验室（强化）、山东省信息功能材料与光电技术实验室、山东省绿色天然产物及医药中间体开发实验室、山东省体适能监测与调控实验室  山东省级高等学校协同创新中心：孔子与山东文化强省战略协同创新中心、信息与能源量子功能材料协同创新中心 山东省级工程技术中心：激光偏光工程技术研究中心日照市工程技术研究中心：日照市信息工程技术研究中心、日照市印刷工程技术研究中心、依日照市电气自动化工程技术研究中心 国家体育总局人文社会科学研究基地：国家体育总局体育社会科学重点研究基地 山东省级强化人文社会科学研究基地：孔子与传统文化研究中心、外国语言文化语翻译研究中心山东省人文社会科学研究基地：山东省体育人文科学研究基地、山东省马克思主义中国化研究基地、山东省儒学研究基地、山东省中西语言文化交流研究基地山东省重点新型智库建设试点单位：中国教育大数据研究院山东省外事研究与发展智库：中外青少年交流与民间外交研究中心 山东省高校优秀科研创新团队建设计划：系统建模优化与控制科研创新团队、湿地生态保护与资源利用创新团队 济宁市优秀科技创新团队：智能控制技术及应用创新团队 共建智库：港澳教育研究中心（与教育部基础教育课程教材发展中心联合成立）、中国教育大数据研究院（与国家统计局中国统计信息服务中心共建） 共建协同创新中心：山东教育大数据协同创新中心（与山东省教育信息中心签约共建） 

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