曲阜师范大学科研成果根据2021年7月学校官网信息显示，建校初期的“公社数学”曾受到毛主席的赞扬，离子交换法制备碳酸钾获1978年全国科学大会奖，高性能晶体偏光器件获2002年国家科技进步二等奖

先后承担了国家“973”计划、“863”计划、国家重点研发计划项目在内的一大批高层次科研项目，在应用数学、激光偏光、电气信息、生物资源开发与利用、土地规划、物理化学、孔子儒学、教育科学、体育科学等学科领域达到了较高水平

“十三五”以来，学校累计承担省部级以上纵向科研项目969项，科研经费近2亿元，其中国家社科基金项目140项，包括重大招标项目2项、重大招标滚动资助1项、重点项目9项；国家自然科学基金项目205项，山东省重大科技项目4项，参与国家重点研发计划项目等4项

获省部级科研成果奖145项

特别在人文社会科学研究方面具有独特优势，2020年以第一单位获得第八届教育部人文社科优秀成果奖一等奖1项、二等奖3项，居省属高校第1位，打破了山东省属高校12年来一等奖空缺的局面；近五年国家社科基金课题和教育部人文社科项目立项总数居省属高校前3位，连续10年获得山东省社会科学优秀成果奖一等奖

自然科学方面，2019年，获山东省属高校唯一1项国家自然科学奖二等奖；2019、2020连续两年获省自然科学奖数量居省属高校第1位，自然指数排名全国83位

 国家自然科学二等奖：不确定性系统的辨识与控制（2015年，合作） 、时延系统的鲁棒控制理论与方法（2019年，合作） 

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