澳门科技大学优势学科截至2021年11月，澳门科技大学共7个学科进入ESI全球前1%：生物学与生物化学、工程学、分子生物学与遗传学、药理毒理学、计算机科学、临床医学、社会科学（综合）
2022年泰晤士高等教育世界大学学科排名中，澳门科技大学“计算机科学“位列世界第101-125，“临床与健康”位列世界第251-300，“商业与经济学”位列世界第301-400
2022年软科世界一流学科排名中，澳门科技大学“控制科学与工程”位列世界第51-75，“旅游休闲管理”位列世界第76-100，“计算机科学与工程”位列世界第151-200，“通信工程”位列世界第201-300，“药学”位列世界第201-300，“基础医学”位列世界第201-300，“地球科学”位列世界301-400，“电力电子工程”位列世界第301-400，“生物学”位列世界第400-500
澳门科技大学商学院会计硕士学位课程获得英国ACCA认证、工商管理学士（会计学）课程获得ACCA澳洲会计师公会（CPA Australia）专业认证、英国注册管理会计师协会（CIMA）专业认证、工商管理学士（供应链管理）课程获得英国特许物流运输协会（CILT）专业认证
澳门科技大学医学院获得英国爱丁堡皇家外科学院授予的全面技能发展认可培训中心资格
澳门科技大学酒店与旅游管理学院旅游管理博士学位课程、国际旅游管理硕士学位课程、国际旅游管理学士学位课程、酒店管理学士学位课程、餐饮管理学士学位课程全部以高分获得联合国世界旅游组织教育品质认证（TedQual）优质认证与续期
科大医院临床化验诊断中心为全澳唯一获得ISO：15189国际认证的医学临床检验室
澳门科技大学优势学科及部分国际认证
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