中国人民解放军海军军医大学科研成果2005年，海军军医大学吴孟超院士荣获国家最高科学技术奖，成为全国卫生系统、全军后勤系统和上海市荣获此殊荣的第一人 ；肝胆外科荣获国家科技进步奖创新团队奖，全国仅三家获此殊荣；近3年（截至2013年），国家科学技术奖励数位居全国首位（9项），新药创制重大专项和军特药重大专项（29项）位居全军医科院校第一

根据2017年8月学校官网显示，学校还先后牵头承担国家“863计划”、“973计划”等重点项目140多项、承担各类研究课题3200余项，经费总额近15亿元，名列全军前茅；在《自然·免疫学》、《自然·遗传学》、《柳叶刀》等世界顶级学术杂志发表论文30余篇，发表SCI论文共3000多篇，数量跃升全国医科院校第二，多篇论文入选“中国百篇最具影响优秀国际学术论文”；多项成果入选“中国医药十大科技进展”和“中国高等学校十大科技进展”项目，获批新药和专利授权数连续多年位居全军院校第一

 根据2017年8月学校官网显示，学校先后获得国家最高科学技术奖1项，国家科学技术进步奖一等奖2项、国家自然科学奖二等奖4项，国家科技进步创新团队奖1项，国家技术发明奖二等奖5项，国家科学技术进步奖二等奖32项，省部级二等奖以上成果600余项

 奖项年份获奖者国家最高科学技术奖2005吴孟超国家科技进步一等奖（肝脏疾病手术治疗的临床研究）1985吴孟超等国家自然科学二等奖（树突状细胞的抗原提呈、功能调控及其来源的新基因的功能研究）2003曹雪涛等恶性肿瘤磷酸化调控的信号传导研究2006王红阳等恶性肿瘤细胞抗原提呈喝生物调变机理研究2007郭亚军等血压波动性和器官损伤的研究2009苏定冯乙肝病毒变异和免疫遗传在肝细胞癌发生发展中的新机制 2019曹广文国家技术发明二等奖（疟疾和矽肺治疗新药羟基哌喹及磷酸盐）1985许德宇等SM-1在诱导三眼蚕生产超细纤度蚕丝的应用1988刘丽琳等肿瘤放疗增敏药甘氨双唑钠并获批化学药品2005郑秀龙等治疗类风湿性关节炎等疾病的抗体融合蛋白药物并获批生物制品一类新药2007郭亚军等全国百篇优秀博士论文年份获奖人导师题目2001章卫平曹雪涛BCL-6同源新型锌指蛋白DPZF的生物学功能及其作用机理2002陈哲宇路长林GFR-1与GDNF结合位点分析及其下游信号转导的研究2002赵 健郭亚军肿瘤抑制基因TIP30对细胞增殖的调节作用及在肿瘤生物治疗中的意义2002黄 欣曹雪涛凋亡相关蛋白DEDDL在免疫细胞凋亡及活化过程中调控机制的研究2003缪朝玉戚中田血管外膜舒张因子的生物学意义2004李 楠时玉航人树突状细胞来源的新分子Siglec-10和人骨髓基质细胞来源的新分子PHDP的克隆与功能研究2005张明徽王荣福脾基质细胞对造血前体细胞的定向诱导作用及对树突状细胞生物学特性的影响2006陈涛涌张卫东来源于人树突状细胞的新型癌基因样小G蛋白RabJ的生物学功能研究2006张 琪安华章双调控减毒增殖腺病毒CNHK500治疗肝癌的实验研究2007郭振红谢渭芬凋亡信号和免疫微环境对树突状细胞的调控作用2009韩岩梅姜远英新型免疫抑制性细胞群（amsc）的发现和功能研究

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