京都大学校区吉田校区自建校以来一直是大学的核心，主校既有建校时期的砖砌建筑，如已成为大学标志的钟楼百年纪念堂，也有现代实验室建筑
吉田校区真实地以有形的形式展现了京都大学的历史
校园进一步细分为七个部分
宇治校区原为日本帝国陆军所有，于1949 年归京都大学所有
该校区现在是一系列致力于自然科学和能源的研究机构、中心和大型测试设施的所在地相关领域
京都大学的第三校区桂校区由四个校区组成
桂校区被设想为“技术科学山”，是技术与科学以令人兴奋的新方式融合的场所
这个探索新知识领域的创新基地于2003年10月开放
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