海德堡大学宗教改革尽管马丁·路德于1518年倡导宗教改革，海德堡大学长时间均未受此影响
直到1556年时才由奥腾里希（Ottheinrich）大公将其转变为一个新教大学
16世纪后半叶由弗里德里希三世（Friedrich III）将海德堡大学建成了具有加尔文主义精神的欧洲科学与文化中心
其加尔文主义理念的光芒吸引了全欧众多教授与学者纷涌而至
在神学院的影响下，1563年出现了著名的海德堡教理问答录
除加尔文主义外，16世纪末出现了后人文主义
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