法国远东学院学院发展1898年，为了研究西贡市（今胡志明市）一带的风土文化，当时的法属印度支那总督杜梅下令创立「法国印度支那古迹调查会」（或译作「法国印度支那考古学调查会」），由“法国金石铭文与文艺学院”负责学术监督
1900年该会更名为法国远东学院，并於1901年开始出版《法国远东学院学刊》（Bulletin de l'Ecole Française d'Extrême-Orient）
该学院于1902年将总部设於河内，於1950年代因越南战争关系迁至巴黎
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