加利福尼亚大学圣迭戈分校专业研究学院加州大学圣地亚哥分校设有5个学术型研究学部（Division）和5个专业型研究学院（School），提供研究生学位教育和本科专业课程

五个学术型研究学部包括：艺术人文学部（Art and Humanities）生物科学学部（Biological Sciences）物理科学学部（Physical Sciences）社会科学学部（Social Sciences），包括人类学（Anthropology）、认知科学（Cognitive Science）、人际沟通（Communication）、经济学（Economics）、教育学（Education Studies）、种族研究（Ethnic Studies）、语言学（Linguistics）、政治科学（Political Science）、心理学（Psychology）、社会学（Sociology）斯克利普斯海洋研究院（Scripps Institution of Oceanography）五个专业型研究学院包括：雅各布斯工程学院（Jacobs School of Engineering）雷迪管理学院（Rady School of Management）全球政策与战略学院（School of Global Policy and Strategy）斯卡格斯药剂学院（Skaggs School of Pharmacy & Pharmaceutical Sciences）医学院（School of Medicine）

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