哥本哈根大学四大校区Nørre Campus（北校区）：包含了大部分的健康-医药学院和部分自然科学学院，新的药学中心 (Pharma Science Centre)、马士基大楼 (The Mærsk Building)、尼尔斯·玻尔大楼 (The Niels Bohr Building) 已竣工或正在兴建中，未来会将该校区规划成哥本哈根科学城 (Copenhagen Science City) ；Frederiksberg Campus（腓特烈堡校区）：自然科学学院的主校区，同时包含部分健康-医药学院，2016年初启用新的哥本哈根植物学中心 (Copenhagen Plant Science Centre) ；City Campus（城市校区）：现社会科学学院、法学院、神学院、行政部门所在地，也包含了部分自然科学学院及健康-医药学院，在获得丹麦环境部VILLUM基金会、诺和诺德基金会等多个基金会的资助后，新的自然历史博物馆亦在计划中；Søndre Campus（南校区）：主要是人文学院和小部分自然科学学院，预计2016/17学年冬季扩建 (KUA3) 完成，届时法学院和神学院亦将迁址至此；

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