查理大学院系分布天主教神学院（Katolická teologická fakulta）新教神学院（Evangelická teologická fakulta）胡斯神学院（Husitská teologická fakulta）法学院（Právnická fakulta）布拉格第一医学院（1. lékařská fakulta）布拉格第二医学院（2. lékařská fakulta）布拉格第三医学院（3. lékařská fakulta）皮尔森医学院（Lékařská fakulta v Plzni）赫拉德茨-克拉洛韦医学院（Lékařská fakulta v Hradci Králové）赫拉德茨-克拉洛韦药学院（Farmaceutická fakulta v Hradci Králové）文学院（Filozofická fakulta）理学院（Přírodovědecká fakulta）数学与物理学院（Matematicko-fyzikální fakulta）教育学院（Pedagogická fakulta）社会科学学院（Fakulta sociálních věd）体育学院（Fakulta tělesné výchovy a sportu）人文学院（Fakulta humanitních studií）

以上内容由大学时代综合整理自互联网，实际情况请以官方资料为准。