塔尔图大学历史沿革学校建于1632年瑞典国王阿道夫·古斯塔夫二世（Gustavus II Adoplphus）统治时期，是瑞典王国历史上继乌普萨拉大学 (University of Uppsala)之后的第二所大学，称为古斯塔夫学院，哈佛大学也创立于同年，1632年春天古斯塔夫学院迎来了首位学生
第一次世界大战后，1919年爱沙尼亚取得独立，古斯塔夫学院更名为塔尔图大学，被尊为“爱沙尼亚的启蒙圣母”
自爱沙尼亚自1991年再次独立以来，爱许多政要和知名人士均毕业或曾任教于该校
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