塔尔图大学合作交流在欧盟伊拉斯谟交流项目中，塔尔图大学已经与26个国家超过200个高校建立了基于伊拉斯谟框架内的合作，该项目的主要交流国家为法国，德国，芬兰，意大利和西班牙
除此之外塔尔图大学还积极与全球共60多个国家建立了校际合作
如今，塔尔图大学也已经与中国各大高校建立了交流合作项目，如清华大学，同济大学，香港浸会大学，东南大学，上海交通大学，上海大学等高校
伦敦大学学院斯拉夫东欧研究院与塔尔图大学合作开展IMESS国际硕士研究生项目，加强爱沙尼亚与英国高等教育的合作交流，深入研究关于地缘政治、经济、文化、语言和历史的区域性影响
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